外部建筑一切准备就绪之后，就面临要饲养的犬只的选择问题。
对于一个致力于繁殖事业的犬舍来说，一只成熟的德国牧羊公犬在育种上是不可或缺的，有品质优良的种公犬才能培育出符合标准定的下一代，但是切记，种母犬才是你的资本，有好的种母犬，才能培育出属于自己犬舍的幼犬。
因考虑到血缘形态的问题，大部分国家和地区都会进口种犬。
目前，世界牧羊犬协会的所有会员国都采用德国的品种。
如果要进口种犬，有些事项需要格外注意。
例如，如果直接从德国进口，最好直接和育种者接洽，不要通过中间商。
所有犬龄超过2岁的德国牧羊犬，都应该做过登记，各项证明证书齐全，几个月大的犬，也都应有血统证书，另外还需要特别注意幼犬的父母犬是否都有血统证明。
德国牧羊犬协会的会刊上会有已登记的纯种狗记录，应多加关注。